超薄切片
超薄切片是TEM生物样品的制备技术之一，可以制备厚度小于100 nm的TEM生物组织切片。
超薄切片的大致步骤如下：1.从生物活体上取下1mm×1mm×1 mm大小的样品，并浸入固定液固定样品。 2.使用丙酮对样品做脱水处理，然后用环氧树脂包埋。 3.使用超薄切片机从包埋样品上切取薄片试样，其过程为修块、对刀、切片、捞片。制好的切片放在载网上。
经过以上步骤制好后，将样品载网放入TEM中观察切片形貌。
滴样+负染
滴样+负染是TEM生物样品的制备技术之一，可以用于观察细胞器、病毒、生物大分子如蛋白质等等。
所谓负染，即负染色，又称为阴性染色，指的是制备出的样品在电镜下观察时，被观察对象是亮的，背景是暗的。负染色技术使用金属盐对铺展在载网上的样品进行染色，使整个载网都铺上一层重金属盐，重金属对电子散射作用较强，因此整个背景较暗；而有凸出颗粒的地方则没有染料沉积，对电子散射作用较弱，因此较亮。与之相对应的是正染色，正染色的样品的被观察样品是暗的，背景则是亮的。
制样时可采用悬滴法，先把样品分散在液体中制成悬浮液，用滴管吸取一滴样品悬液，滴在有支持膜的铜网上，以使被观察对象转移到铜网上。再滴上负染色液染色，再清洗，干燥后即可用于电镜观察。
快速冷冻制样
快速冷冻制样可以在极短时间内对生物样品进行冷冻处理，样品内部的水转变为玻璃态而非结晶态
避免了水的结晶膨胀给样品带来的破坏。这种生物样品制样方法无需干燥处理，最大程度地保留了原本的生物结构。
制备的冷冻样品使用冷冻电镜来观察，整个制样-传输-检测过程均在低温下进行。
